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开放反应数据库(ORD)(开放数据库是什么意思)

ccvgpt 2024-11-15 16:45:15 基础教程 6 ℃
先前本公众号介绍了二维材料数据库(最新二维材料数据库介绍)、功函数据库(元素晶体功函数据库)、HSE带隙数据库(上万个无机半导体材料的HSE带隙数据库)、扫描隧道显微镜(STM)图像数据库(716种二维材料扫描隧道显微镜(STM)图像数据库)、扩展的香农离子半径数据库(使用机器学习扩展Shannon的离子半径数据库)、材料设计开放数据库集成(材料设计开放数据库集成 (OPTIMADE))、三维材料热电性质数据库(上大杨炯课题组开发三维材料热电性质数据库(MIP-3d)).

目前,期刊文章、专利、甚至电子实验室笔记本中的化学反应数据以各种格式存储,通常是非结构化的,这对下游应用(包括机器学习模型的训练)构成了重大障碍。剑桥Steven M. Kearnes和Connor W. Coley等人提出了开放反应数据库(ORD),这是一个开放的模式和基础设施,用于结构化和共享有机反应数据,包括一个集中的数据存储库。ORD模式支持传统和新兴技术,从台式反应到自动高通量实验和流动化学。数据、模式、支持代码和基于网络的用户界面都在GitHub上公开提供。他们的愿景是,一个一致的数据表示和支持数据共享的基础设施将使下游应用大大改善计算机辅助合成计划、反应预测和其他预测性化学任务方面的技术水平。


开放反应数据库(ORD)(开放数据库是什么意思)

开放反应数据库(ORD)链接:

https://docs.open-reaction-database.org

开放反应数据库(ORD)原理文章:

https://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/jacs.1c09820


Steven Kearnes个人主页:

https://scholar.google.com/citations?user=LxJEYK4AAAAJ&hl=en

附录:
全球四大知名材料数据库:
Materials Project (https://materialsproject.org)
JARVIS (https://jarvis.nist.gov/jarvisdft)
AFLOW (http://www.aflowlib.org)
OQMD (http://oqmd.org)

国内材料数据库:
https://atomly.net
https://alkemine.cn
http://www.pkusam.com/data-base.html
http://nlo.hbu.cn

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